Смилането на мазнините започва още преди храната да влезе в стомаха, като химическото смилане започва в устата. Тялото продължава да смила мазнините, докато храната се движи през храносмилателния тракт.
Усвояването на протеини се осъществява предимно в тънките черва (дванадесетопръстник), където храносмилателните ензими ги разграждат на аминокиселини, дипептиди (две аминокиселини) и трипептиди (три аминокиселини).
Правилото за последователността в храненето се основава на терорията, според която най-лесно смилаемите храни трябва да се консумират преди по-трудно смилаемите. Така например, първо трябва да се изяде ябълката, за да премине успешно своя път, без да й пречи някакъв тестен продукт примерно.
